EEGLAB合辑 | 第一节 往EEGLAB导入数据
1、學(xué)習(xí)Matlab
EEGLAB圖形界面建立在強(qiáng)大的Matlab腳本語(yǔ)言之上。要使用EEGLAB構(gòu)建宏命令和執(zhí)行自定義和自動(dòng)化處理的全部功能，就需要能夠在Matlab中操縱EEGLAB數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)。由于時(shí)間限制，這個(gè)wiki沒(méi)有提供關(guān)于Matlab腳本語(yǔ)言的介紹。相反，用戶需要在開(kāi)始研究之前熟悉Matlab。
2、安裝EEGLAB和教程文件
首先下載包含教程數(shù)據(jù)集的EEGLAB（30MB），附下載地址。
（https://sccn.ucsd.edu/eeglab/downloadtoolbox.php）
解壓EEGLAB時(shí)，您將獲得一個(gè)名為“eeglabxxxx”的文件夾（注意：當(dāng)前版本號(hào)“xxxx”將有所不同）。在Windows下，Matlab通常建議將工具箱放在Application/MatlabRxxxx/toolbox/文件夾中（注意：該名稱應(yīng)隨Matlab版本的“xxxx”而變化）。在Linux中，Matlab工具箱文件夾通常位于/usr/local/pkgs/Matlab rxxxx/toolbox/和Mac中的“/Application/Matlab_rxxxx”。您也可以將文件夾放在路徑上的任何其他位置。
3、啟動(dòng)Matlab和EEGLAB
這里我們將啟動(dòng)Matlab和EEGLAB。
關(guān)鍵步驟1：啟動(dòng)Matlab
Windows：開(kāi)始，找到Matlab并運(yùn)行它。
Mac：從dock或應(yīng)用程序文件夾中的Matlab圖標(biāo)開(kāi)始。
Linux：打開(kāi)一個(gè)終端窗口，輸入“matlab”，然后按enter鍵。
關(guān)鍵步驟2：切換到EEGLAB目錄（文件夾）
您可以通過(guò)單擊屏幕右上角標(biāo)有“…”的按鈕來(lái)瀏覽目錄。這將打開(kāi)下面的窗口。雙擊目錄即可進(jìn)入。雙擊文件夾列表中的“.”可將您提升到上一個(gè)層級(jí)的目錄。一旦找到你想要的文件夾或目錄，點(diǎn)擊OK。或者，從命令行使用“cd”（change direction）來(lái)到達(dá)所需的目錄。
關(guān)鍵步驟3：啟動(dòng)EEGLAB
在Matlab命令行中輸入“eeglab”，然后按enter鍵。EEGLAB將自動(dòng)添加到Matlab路徑中。
下面的藍(lán)色主EEGLAB窗口將彈出，它有七個(gè)菜單標(biāo)題：文件、編輯、工具、繪圖、研究、數(shù)據(jù)集、幫助，按典型的（從左到右）使用順序排列。
探索嘗試（可選）：將EEGLAB添加到Matlab路徑
您可能需要將EEGLAB文件夾添加到Matlab搜索路徑中，以便下次啟動(dòng)Matlab時(shí)能夠直接打開(kāi)EEGLAB。如果您是通過(guò)Matlab的圖形界面啟動(dòng)的，請(qǐng)轉(zhuǎn)到“文件”菜單項(xiàng)并選擇“設(shè)置路徑”。這將打開(kāi)以下窗口。
或者，如果從命令行運(yùn)行Matlab，鍵入“pathtool”并單擊return；這也將調(diào)用此窗口。單擊標(biāo)記為Add folder的按鈕并選擇文件夾“eeglabxxxxx”，然后單擊“確定”（EEGLAB將負(fù)責(zé)添加其子文件夾本身）。在pathtool窗口中點(diǎn)擊save，這將使EEGLAB調(diào)用函數(shù)“EEGLAB”在以后的Matlab命令行中可用。注意，如果您安裝的是更新版本的EEGLAB，最好從Matlab路徑中刪除舊版本（選擇，然后點(diǎn)擊刪除），以避免調(diào)用過(guò)時(shí)的例程。最好不要添加“eeglab”路徑及其子文件夾，而是讓eeglab管理路徑（當(dāng)您啟動(dòng)“eeglab”時(shí)，它會(huì)自動(dòng)添加所需的路徑。
4、打開(kāi)現(xiàn)有數(shù)據(jù)集
關(guān)鍵步驟4：加載示例EEGLAB數(shù)據(jù)集
選擇菜單項(xiàng)“文件”，然后按子菜單項(xiàng)“加載現(xiàn)有數(shù)據(jù)集”。在本教程的其余部分中，我們將使用約定：Menu_item>Submenu_item來(lái)引用菜單選擇（例如，這里選擇Load existing dataset子目錄來(lái)加載數(shù)據(jù)集）。
在Unix中，將彈出以下窗口：
要了解如何從您自己的數(shù)據(jù)創(chuàng)建EEGLAB數(shù)據(jù)集，請(qǐng)參閱有關(guān)導(dǎo)入數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)事件的教程：
https://sccn.ucsd.edu/wiki/A01:_Importing_Continuous_Epoched_Data
選擇文件”eeglab_dataset.set”，位于EEGLAB的“sample_data”文件夾中，也可以在此處下載：
https://sccn.ucsd.edu/mediawiki/images/9/9c/Eeglab_data.set）
然后導(dǎo)入EEGLAB.當(dāng)數(shù)據(jù)集被EEGLAB加載時(shí)，EEGLAB主窗口顯示關(guān)于它的相關(guān)信息——它的通道數(shù)、采樣率等。
5、事件標(biāo)簽
在教程數(shù)據(jù)集中腦電圖事件結(jié)構(gòu)字段type、position和latency是為數(shù)據(jù)集中標(biāo)記的154個(gè)事件中的每個(gè)事件指定的。我們接下來(lái)編輯事件標(biāo)簽的值。
選擇菜單Edit > Event Values 以調(diào)出一個(gè)窗口，在其中我們可以讀取和編輯這些值：
按上面的>、>>、<和<<鍵來(lái)滾動(dòng)選擇標(biāo)簽。現(xiàn)在，我們將簡(jiǎn)要描述生成示例數(shù)據(jù)集的實(shí)驗(yàn)。
6、示例實(shí)驗(yàn)描述
在這個(gè)實(shí)驗(yàn)中，有兩種類型的事件“square”和“rt”；“square”事件對(duì)應(yīng)于顯示器中綠色正方形中填充的方塊的出現(xiàn)，“rt”表示被試按下按鈕。
方塊可以顯示在屏幕上的五個(gè)正方形中的任何一個(gè)，一個(gè)是綠色的，其他四個(gè)是藍(lán)色的，沿著水平軸分布。這里我們只考慮左側(cè)的表示，即位置字段所指示的位置1和位置2（水平視角分別約為5.5度和2.7度）。
在這個(gè)實(shí)驗(yàn)中，受試者僅關(guān)注計(jì)算機(jī)屏幕上的一個(gè)選定位置（綠色方塊），只有當(dāng)方塊出現(xiàn)在這個(gè)位置時(shí)，他們才會(huì)快速按下拇指按鈕。他們將忽略其他位置（藍(lán)色方塊）出現(xiàn)的圓圈。為了減少下載和處理所需的數(shù)據(jù)量，此數(shù)據(jù)集僅包含單個(gè)受試者左視野注意位置的目標(biāo)（即“正方形”）刺激。關(guān)于這個(gè)實(shí)驗(yàn)的更多細(xì)節(jié)，見(jiàn)Makeig等人（Science,2002,295:690-694）。
在EEGLAB數(shù)據(jù)集中使用事件時(shí)，有兩個(gè)必需的事件字段：type和latency，以及任意數(shù)量的其他用戶定義的信息字段。這里必須理解字段的名稱是由創(chuàng)建數(shù)據(jù)集的用戶定義的，并且可以根據(jù)需要?jiǎng)?chuàng)建、保存和加載任意多個(gè)事件字段。
還要注意，type和latency（小寫(xiě)）是EEGLAB明確識(shí)別的兩個(gè)關(guān)鍵字，除非導(dǎo)入epoch事件信息，否則這些字段必須由用戶定義（注意：如果只定義了field latency，那么EEGLAB將為每個(gè)事件創(chuàng)建一個(gè)常量默認(rèn)值為1的字段類型）。除非定義了這兩個(gè)字段，否則EEGLAB將無(wú)法正確處理事件以提取epochs、繪制反應(yīng)時(shí)間等。導(dǎo)入數(shù)據(jù)教程將解釋如何導(dǎo)入事件信息和定義字段。
7、關(guān)于此數(shù)據(jù)集
這里我們描述如何編輯和查看描述當(dāng)前數(shù)據(jù)集并作為該數(shù)據(jù)集的一部分存儲(chǔ)的文本字段，選擇Edit > About this dataset 。彈出一個(gè)文本編輯窗口，允許用戶編輯當(dāng)前數(shù)據(jù)集的描述。
對(duì)于示例數(shù)據(jù)，我們輸入了以下描述，完成后按SAVE。
8、滾動(dòng)查看數(shù)據(jù)
在這里，我們將學(xué)習(xí)如何可視化和拒絕連續(xù)EEG通道數(shù)據(jù)的選定部分。
選擇Plot > Channel data (scroll)，這將彈出eegplot（）下面的滾動(dòng)數(shù)據(jù)顯示窗口，請(qǐng)注意，此示例數(shù)據(jù)文件包含的看起來(lái)是連續(xù)的EEG數(shù)據(jù)。
為了減少下載時(shí)間，這個(gè)“偽連續(xù)”EEG數(shù)據(jù)集實(shí)際上是通過(guò)連接80個(gè)獨(dú)立的3秒數(shù)據(jù)周期（稍后我們將再次分開(kāi)）來(lái)構(gòu)建的，這解釋了在某些數(shù)據(jù)通道中可能會(huì)看到的一些突然跳變。
繪圖窗口的右側(cè)是垂直刻度值（及其單位微伏），表示垂直刻度條的“振幅”。在這種情況下，該值為80（微伏）。同樣的值也顯示在右下角的編輯框中，我們可以按照下面的說(shuō)明更改它。通過(guò)反復(fù)單擊“-”按鈕或從鍵盤(pán)編輯文本值，將”scale”編輯文本框的值更改為大約50，然后按Enter鍵更新滾動(dòng)窗口。
要調(diào)整顯示的時(shí)間范圍（即水平刻度），請(qǐng)選擇eegplot()菜單項(xiàng)Settings > Time range to display，然后將所需窗口長(zhǎng)度設(shè)置為“10”秒，如下所示：
然后按OK使指示的更改生效。
要調(diào)整顯示的通道數(shù)，請(qǐng)選擇菜單項(xiàng)Settings > Number of channels to display，然后輸入要在屏幕上顯示的所需通道數(shù)（例如“16”）。
減少顯示的通道數(shù)將返回一個(gè)滾動(dòng)窗口，在繪圖的左側(cè)有一個(gè)垂直的通道設(shè)置滑塊。使用它可以在所有通道中滾動(dòng)顯示（垂直）。
要放大數(shù)據(jù)窗口的特定區(qū)域，請(qǐng)選擇菜單項(xiàng)Settings > Zoom off/on > Zoom on。現(xiàn)在使用鼠標(biāo)，在數(shù)據(jù)區(qū)域周圍拖動(dòng)一個(gè)矩形以放大它。滾動(dòng)窗口現(xiàn)在看起來(lái)可能與下面的類似。單擊鼠標(biāo)右鍵再次縮小。使用Setting > Zoom off/on > Zoom off菜單項(xiàng)關(guān)閉縮放選項(xiàng)。
要在數(shù)據(jù)上顯示水平（x）和垂直（y）柵格線，請(qǐng)選擇Display > Grid > X grid on 或Display > Grid > Y grid on. 。重復(fù)此過(guò)程以關(guān)閉任一網(wǎng)格線。
另外，使用者也可以刪除(REJECT)連續(xù)數(shù)據(jù)的任意部分。
關(guān)閉當(dāng)前的窗口，并在主EEGLAB窗口中選擇Tools > Reject Continuous Data by eye。出現(xiàn)警告消息則單擊繼續(xù)。要REJECT選定的數(shù)據(jù)部分，首先在感興趣的時(shí)間區(qū)域水平拖動(dòng)鼠標(biāo)（按住鼠標(biāo)左鍵），將其標(biāo)記為REJECT。如果您愿意，可以用這種方式標(biāo)記多個(gè)要REJECT的區(qū)域。要撤消REJECT標(biāo)記，請(qǐng)單擊標(biāo)記的區(qū)域。
注意：必須禁用縮放以選擇部分?jǐn)?shù)據(jù)。
現(xiàn)在，要?jiǎng)h除標(biāo)記的數(shù)據(jù)區(qū)域，請(qǐng)單擊（右下角）REJECT按鈕（上圖）。將創(chuàng)建一個(gè)新的數(shù)據(jù)集，刪除標(biāo)記的區(qū)域。注意：EEGLAB還將向新數(shù)據(jù)集事件列表添加新的“REJECT邊界”事件，并將這些事件鏈接到包含在腦電圖結(jié)構(gòu)。REJECT邊界事件確保后續(xù)的數(shù)據(jù)選擇不會(huì)跨越非連續(xù)的REJECT邊界。有關(guān)REJECT連續(xù)數(shù)據(jù)區(qū)域和數(shù)據(jù)時(shí)期的更多詳細(xì)信息，請(qǐng)參閱數(shù)據(jù)REJECT教程。
單擊下面的”O(jiān)K”以創(chuàng)建新的數(shù)據(jù)集，并刪除標(biāo)記的數(shù)據(jù)部分。
按”O(jiān)K”創(chuàng)建新數(shù)據(jù)集，EEGLAB主窗口現(xiàn)在看起來(lái)像：
由于我們執(zhí)行此刪除只是為了說(shuō)明目的，請(qǐng)通過(guò)選擇主窗口菜單項(xiàng)Datasets > Dataset 1: Continous EEG data 切換回原始數(shù)據(jù)集。要?jiǎng)h除新創(chuàng)建的第二個(gè)數(shù)據(jù)集，請(qǐng)選擇File > Clear dataset(s) 或 Edit > Delete dataset(s)，然后輸入數(shù)據(jù)集索引“2”，如下所示，然后按“OK”。
第二個(gè)數(shù)據(jù)集現(xiàn)在將從EEGLAB/Matlab工作區(qū)中刪除。
（注意：在刪除第二個(gè)數(shù)據(jù)集之前，不必切換回第一個(gè)數(shù)據(jù)集。通過(guò)輸入由空格分隔的索引，也可以從該窗口中一次刪除多個(gè)數(shù)據(jù)集。）
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的EEGLAB合辑 | 第一节 往EEGLAB导入数据的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。
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