python panda apply_python – Pandas – 关于apply函数缓慢的解释
關于你的第一個問題,我不能確切地說為什么這個例子很慢.但通常,apply不會利用矢量化.此外,apply返回一個新的Series或DataFrame對象,因此對于一個非常大的DataFrame,你有相當大的IO開銷(我無法保證在Pandas有大量內部實現優化的情況下,這種情況是100%的情況).
對于您的第一種方法,我假設您嘗試使用p_dict作為查找表填充df中的“值”列.使用pd.merge快大約1000倍:
import string, sys
import numpy as np
import pandas as pd
##
# Part 1 - filling a column by a lookup table
##
def f1(col, p_dict):
return [p_dict[p_dict['ID'] == s]['value'].values[0] for s in col]
# Testing
n_size = 1000
np.random.seed(997)
p_dict = pd.DataFrame({'ID': [s for s in string.ascii_uppercase], 'value': np.random.randint(0,n_size, 26)})
df = pd.DataFrame({'p_id': [string.ascii_uppercase[i] for i in np.random.randint(0,26, n_size)]})
# Apply the f1 method as posted
%timeit -n1 -r5 temp = df.apply(f1, args=(p_dict,))
>>> 1 loops, best of 5: 832 ms per loop
# Using merge
np.random.seed(997)
df = pd.DataFrame({'p_id': [string.ascii_uppercase[i] for i in np.random.randint(0,26, n_size)]})
%timeit -n1 -r5 temp = pd.merge(df, p_dict, how='inner', left_on='p_id', right_on='ID', copy=False)
>>> 1000 loops, best of 5: 826 ?s per loop
關于第二個任務,我們可以快速向p_dict添加一個新列,它計算時間窗口從min_week_num開始的平均值,并在p_dict中該行的一周結束.這要求p_dict按WEEK列的升序排序.然后你可以再次使用pd.merge.
我假設min_week_num在以下示例中為0.但您可以輕松修改rolling_growing_mean以獲取不同的值. rolling_growing_mean方法將在O(n)中運行,因為它每次迭代執行固定數量的操作.
n_size = 1000
np.random.seed(997)
p_dict = pd.DataFrame({'WEEK': range(52), 'value': np.random.randint(0, 1000, 52)})
df = pd.DataFrame({'WEEK': np.random.randint(0, 52, n_size)})
def rolling_growing_mean(values):
out = np.empty(len(values))
out[0] = values[0]
# Time window for taking mean grows each step
for i, v in enumerate(values[1:]):
out[i+1] = np.true_divide(out[i]*(i+1) + v, i+2)
return out
p_dict['Means'] = rolling_growing_mean(p_dict['value'])
df_merged = pd.merge(df, p_dict, how='inner', left_on='WEEK', right_on='WEEK')
總結
以上是生活随笔為你收集整理的python panda apply_python – Pandas – 关于apply函数缓慢的解释的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
- 上一篇: python 面试题 2020_2020
- 下一篇: python中not加变量是_MyPyt