领域应用 | OMAHA联盟发布“疾病临床表现”、“中毒”知识图谱及OMAHA知识库
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資源發布
OMAHA已建立“七巧板”醫學術語集、“匯知”醫學知識圖譜、元數據等資源,將于每月發布其中一項。具體各項發布時間為:“七巧板”術語集于每季度第一個月20日發布,?“匯知”圖譜于每季度第二個月20日發布,元數據于每季度第三個月20日發布。敬請關注!
“匯知”醫學知識圖譜是OMAHA聯盟發布的醫學知識圖譜資源的總稱,主要切入疾病、手術操作、檢驗檢查、藥品的知識,在每個季度第二個月20號定期發布。截止2020年11月,“匯知”圖譜已發布“藥品適應證”、“臨床路徑”、“疾病科室”、“心血管專科疾病”和“新型冠狀病毒肺炎”領域知識圖譜。本季度首次發布“疾病臨床表現”、“中毒”知識圖譜及OMAHA知識庫,并更新發布“藥品適應證”知識圖譜。
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新發布圖譜資源
“疾病臨床表現”知識圖譜
近年來,醫學知識圖譜很重要的應用方向之一就是醫學領域的問答系統,例如醫院的智能導診機器人、線上掛號和線上問診等系統。互聯網診療中的問診系統通過提取用戶問題中的關鍵詞,以醫學知識圖譜為支撐,形成答案返回給用戶。它的本質就是通過在醫學知識圖譜中查詢“疾病-臨床表現”關系來完成患者的自查。新冠疫情的出現讓越來越多人開始選擇線上就診。基于此需求,聯盟啟動了“疾病臨床表現”知識圖譜構建工作,希望可以助力問答等相關產品的開發。
“疾病臨床表現”知識圖譜共包含1.5萬實體,8.0萬三元組,其中0.6萬實體與“七巧板”醫學術語集建立映射。“疾病臨床表現”知識圖譜關系模型見圖1。
圖1:“疾病臨床表現”知識圖譜關系模型
“中毒”知識圖譜
據《中國統計年鑒(2020)》顯示,中毒作為部分地區城市和農村居民前5位的死因一直受到大眾的關注。以“中毒”知識圖譜為支撐的醫學人工智能系統,可以輔助醫生鑒別診斷中毒患者,有效縮短診斷時間。尤其在急診環境中,可以協助沒有處理經驗的醫護人員快速開展救治工作,挽救更多的生命。基于此需求,聯盟啟動了“中毒”知識圖譜構建工作。該圖譜包含0.5萬實體,2.4萬三元組,其中0.2萬實體與“七巧板”醫學術語集建立映射。“中毒”知識圖譜關系模型見圖2。
圖2:“中毒”知識圖譜關系模型
OMAHA知識庫
為了使服務機構能夠更便捷地合并使用“匯知”醫學知識圖譜及“七巧板”醫學術語集數據資源,聯盟于2021年第一季度開始發布OMAHA知識庫資源包,發布時間與“匯知”圖譜保持一致,為每個季度第二個月20號,1年發布4次。OMAHA知識庫包含最新版“匯知”圖譜及“七巧板”術語集數據,并遵循“匯知”圖譜發布文件規范。本次OMAHA知識庫共發布102萬實體,587萬三元組。
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更新發布圖譜資源
“藥品適應癥”知識圖譜
為了更好地滿足臨床合理用藥需求,聯盟于2019年啟動“藥品適應證”知識圖譜構建工作,并于同年9月首次發布“藥品適應證”知識圖譜。本次更新發布的“藥品適應證”知識圖譜共包含3.7萬實體, 43.0萬三元組,其中2.4萬實體與“七巧板”醫學術語集映射。更新內容如下:
新增《國家基本醫療保險、工傷保險和生育保險藥品目錄(2020年)》中的醫保支付類別和劑型關系;
新增收錄國家和各省醫保藥品目錄中的藥品實體;
新增收錄國家藥品編碼本位碼(截至2020年12月31日)中的藥品實體。
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在根據國家和各省醫保藥品目錄構建圖譜時,發現有部分藥品名稱不嚴謹或不具有臨床適用性,有少部分藥品暫無查找到可靠來源的藥品說明書。基于這些問題,在構建圖譜時采取了一定的解決措施,詳細情況請見表1。
序號 | 問題類型 | 涉及數量 | ?解決措施 |
1 | 藥品名稱不嚴謹,例如《廣西基本醫療保險、工傷保險和生育保險藥品目錄(2020年版)》中的“感冒清顆粒”,正確名稱應該為“感冒清熱顆粒”。 | 24 | 已將相應的藥品實體名稱修正。 |
2 | 未找到可靠來源的藥品說明書,例如《北京市基本醫療保險工傷保險和生育保險藥品目錄(2017年版)》中的“冠心丹參丸”。 | 33 | 繼續跟進收集這些藥品的說明書,收集后再進一步完善圖譜。 |
3 | 藥品名稱不具有臨床適用性,例如《國家基本醫療保險、工傷保險和生育保險藥品目錄(2020年版)》中的“替加氟氯化鈉”,臨床常用藥品名稱是“替加氟氯化鈉注射液”。 | 909 | 以臨床常用藥品名稱為實體構建適應證關系。 |
表1:基于國家和各省醫保藥品目錄構建藥品適應證關系時發現的問題及解決措施匯總
更多“匯知”醫學知識圖譜的信息您可以登陸HiTA服務平臺(hita.omaha.org.cn)進行了解。
“匯知”醫學知識圖譜發展歷程
2019年8月醫學知識圖譜Schema模型發布
2019年9月“藥品-適應證”知識圖譜發布
2020年5月“臨床路徑”知識圖譜發布
2020年8月“疾病-科室”知識圖譜、“心血管系統疾病”知識圖譜發布
2020年11月“藥品適應證”知識圖譜更新及新型冠狀病毒肺炎診療知識圖譜發布
2021年2月?首次發布“疾病臨床表現”、“中毒”知識圖譜及OMAHA知識庫
2021年5月即將發布更多知識圖譜,敬請期待……
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數字醫學知識中心負責人徐美蘭:meilan.xu@omaha.org.cn
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