jade选峰之后怎么去掉_jade使用教程
1.Jade5.0的安裝和設(shè)置
Jade5.0都是自動(dòng)安裝的,這不成問(wèn)題。要把PDF卡片引入,先將ICDD的光盤插入,然后pdf/setup/select
all/,其它按提示進(jìn)行。
可以對(duì)優(yōu)選項(xiàng)進(jìn)行設(shè)置:EDIT/preference/,里面包括了對(duì)顯示窗口的設(shè)置,儀器參數(shù)的設(shè)置,打印輸出的設(shè)置等。
2 .數(shù)據(jù)的輸入
Jade軟件可以直接讀取Rigaku、Bruker、Philips、Scintag等很多衍射儀的原始數(shù)據(jù)。打開(kāi)File\patterns,將出現(xiàn)如附件中所示畫(huà)面,先(I)找到你文件位置,從(III)的下拉框中選擇你的數(shù)據(jù)格式,按(II)選擇。很多儀器輸出文件的格式都是*.raw,實(shí)際上都是不一樣的,但格式選錯(cuò)了也沒(méi)關(guān)系,軟件會(huì)給你自動(dòng)轉(zhuǎn)到合適的格式中去的。
高級(jí)一點(diǎn)的:有一些數(shù)據(jù)格式在(III)的下拉框中沒(méi)有,比如最常見(jiàn)的txt,xy等,此時(shí)你可以自己動(dòng)手設(shè)置,在以上的數(shù)據(jù)輸入面板中,點(diǎn)擊工具欄上的“import",進(jìn)入格式設(shè)置畫(huà)面,如附件所示,a區(qū)為注釋區(qū),b區(qū)為數(shù)據(jù)格式區(qū),對(duì)于最簡(jiǎn)單的一列角度,一列強(qiáng)度的數(shù)據(jù)格式,a區(qū)不用填寫(xiě),b區(qū)在”angle
column“前打上勾,數(shù)據(jù)從第1行開(kāi)始讀,每行1列數(shù)據(jù),強(qiáng)度數(shù)據(jù)從第8行開(kāi)始(角度不算),角度從1至6列,所得數(shù)據(jù)格式即為附件中所示的數(shù)據(jù)格式。你也可以按照自己的數(shù)據(jù)格式進(jìn)行自由改動(dòng),如果a區(qū)中表明第1行有說(shuō)明文字,則數(shù)據(jù)從第2行讀入,相應(yīng)在b區(qū)就將data
starts改成2。
做完上面的工作后,將文件后綴改為你的數(shù)據(jù)后綴(箭頭所指),再將該格式保存下來(lái)便可大功告成了。
3. 基本功能使用:平滑,扣背底
一張XRD圖譜出來(lái),往往因?yàn)橛锌諝馍⑸?#xff0c;漫散射,熒光以及樣品結(jié)晶差等等原因而造成圖譜上存在許多“毛刺”和較高的背底,雖然提高X光強(qiáng)度能成倍提高信噪比,然而有時(shí)受儀器和樣品所限,這兩項(xiàng)功能需要用到。但根據(jù)我個(gè)人的經(jīng)驗(yàn),要盡量少使用平滑和扣背底,因?yàn)檫@兩項(xiàng)操作帶來(lái)的可能后果就是將一些微弱的有用信息一概抹掉了,特別注意的是,如果將數(shù)據(jù)用來(lái)做Rietveld精修,更不要進(jìn)行這兩項(xiàng)操作。當(dāng)然,如果是將圖譜打印出來(lái)給別人看,適當(dāng)進(jìn)行平滑和扣背底也是個(gè)不錯(cuò)的選擇。
1 平滑
打開(kāi)Filters/smooth
pattern或在快捷工具欄中右鍵點(diǎn)擊也可。隨后將出現(xiàn)一個(gè)懸浮框,最上面的一欄中方塊可以直接用鼠標(biāo)拖動(dòng),大家試試看圖譜會(huì)有什么變化,拖到什么位置,根據(jù)情況而定,我的經(jīng)驗(yàn)是將方塊拖到尖峰的底部出現(xiàn)倒生的毛刺之前。再下面有“parabolic
filter"和”quartic
filter"的選擇,選擇后一個(gè)的效果稍好。再下面還有選擇框,我一般都不管它。作完以上操作后,再用鼠標(biāo)左鍵點(diǎn)擊快捷工具欄中的平滑圖標(biāo)即可。
2 扣背底
打開(kāi)analyze/fit
background或在快捷工具欄中右鍵點(diǎn)擊也可。隨后也出現(xiàn)一個(gè)如附件中所示的懸浮框,(I)處所示代表了背底擬合的級(jí)數(shù),點(diǎn)擊越靠前,該級(jí)數(shù)越高,也可在右邊選擇是一次擬合,抑或二次和三次擬合,試情況而定,背底偏離線性越遠(yuǎn),則擬合的級(jí)數(shù)要求越高。
背底曲線用黃線表示,紅點(diǎn)代表了背底在局部的最高點(diǎn),左鍵點(diǎn)擊圖譜上的某一處便可在此處添加紅點(diǎn),右鍵點(diǎn)擊紅點(diǎn)可以消除該點(diǎn)。背底是否擬合好要靠肉眼觀察。
II所指為背底以下和以上的面積,可以用來(lái)粗略估計(jì)樣品的結(jié)晶度。
以上完成后點(diǎn)擊“removal"即可。
4. 尋峰和峰型擬合
1尋峰
在尋峰之前最好用標(biāo)樣校正過(guò)2theta值,這些都是儀器操作人員的事情,我就不說(shuō)了。
打開(kāi)analyze/find
peaks,或右鍵單擊快捷工具欄中的圖標(biāo)。出現(xiàn)一個(gè)懸浮框,在“search”里面可以對(duì)尋峰的判據(jù)進(jìn)行設(shè)置,大家可以改動(dòng)不同的限制條件,然后按“apply”看看有什么變化。在“Label”里面主要是可以選定標(biāo)注的內(nèi)容,如d值,2
theta值,半峰寬,強(qiáng)度等,這些大家多試幾次就OK了。如果要將尋峰結(jié)果列出,按下“report”即可。
也可以自己手動(dòng)直接在圖譜上標(biāo)峰,大家可以看到有一個(gè)懸浮式快捷編輯框“edit
toolbar”,左鍵點(diǎn)擊第3個(gè)圖標(biāo)。然后就可以直接在峰頂標(biāo)注,如果同時(shí)按住“Ctrl”鍵,則可以在圖譜的任何位置上進(jìn)行標(biāo)注。如果要去掉某個(gè)峰的標(biāo)注,則用鼠標(biāo)將豎線拖到與峰的標(biāo)注線重疊,出現(xiàn)紅顏色之后點(diǎn)擊右鍵即可。如果要?jiǎng)h除所有的峰的標(biāo)注,在窗口中點(diǎn)擊右鍵,選定”Erase
all”即可。
2 峰型擬合
如果要得到精確的峰型,峰位信息,一般都要經(jīng)過(guò)峰型擬合,JADE提供了單峰擬合的功能。在峰型擬合前不要進(jìn)行平滑和扣背底,也不主張預(yù)先自動(dòng)尋峰。
就像前面一位朋友說(shuō)的,對(duì)于重疊峰的分離比較有難度,也可能會(huì)導(dǎo)致軟件“罷工”(我也遇到過(guò)這種情況),但對(duì)于多數(shù)人來(lái)說(shuō),峰型擬合就等同于分峰,因此面對(duì)重疊峰是不可避免的,我的建議是高角度的峰舍棄,并且分峰要一小段接一小段地進(jìn)行(背底嚴(yán)重的除外)。
先在圖譜上選好角度范圍,在編輯欄中左鍵點(diǎn)擊第7個(gè)圖標(biāo),然后再右鍵點(diǎn)擊,將出現(xiàn)一個(gè)峰型擬合的工作框(也可通過(guò)analyze/fit
peak
profile),然后選定你的峰(注意排除Kalfa2)或者按下“initialize”,再按下“refine”即可。有時(shí)不管怎樣似乎都擬合不好,此時(shí)可在工作框中調(diào)整峰型函數(shù),以及“Exponent”和“l(fā)orentzian”的值,也可以調(diào)整背底的類型等,另外,可以重新確定峰位,去掉一個(gè)計(jì)算峰也可以用鼠標(biāo)的右鍵。擬合好壞的標(biāo)準(zhǔn)除了看R因子外,主要是觀察差值線。
按下“report”直接查看結(jié)果,里面也有一些設(shè)置,如要修正的參數(shù),晶粒大小計(jì)算的根據(jù)等,大家在實(shí)踐中多試試,看看結(jié)果會(huì)有什么不同。在結(jié)果的列表中,選定復(fù)選框可以將該峰定義為背底,一行被選定(在圖譜上該峰的標(biāo)注線顯示紅色),按下“Erase”刪除,其它欄目大家都比較熟悉,最后一項(xiàng)為晶粒大小的計(jì)算結(jié)果,要注意的是,這種晶粒大小的計(jì)算是建立在儀器的實(shí)際寬化曲線已存入的基礎(chǔ)上的,否則就按默認(rèn)的儀器曲線(軟件自帶),但不同儀器有不同的寬化曲線,因此最好自己建立,這也是儀器操作人員的事情,我就不多講了,如果有朋友感興趣,可以和我直接交流。再后面的事就是按下“export”進(jìn)行保存了。
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的jade选峰之后怎么去掉_jade使用教程的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。
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