對(duì)于轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測而言，我們昨天的數(shù)據(jù)庫介紹當(dāng)中也提到了。轉(zhuǎn)錄因子主要是通過識(shí)別DNA序列當(dāng)中的基序(motif)來調(diào)控目標(biāo)基因的。所以其實(shí)我們?cè)谥懒艘粋€(gè)基因的motif的時(shí)候就差不多能找到這個(gè)轉(zhuǎn)錄因子都和哪些位置結(jié)合了。但是對(duì)于預(yù)測的結(jié)果和現(xiàn)實(shí)還是有區(qū)別的。因?yàn)檎婧松锏暮薉NA并不是裸露的，而是與組蛋白結(jié)合形成染色體的基本結(jié)構(gòu)單位核小體，核小體再經(jīng)逐步的壓縮折疊最終形成染色體高級(jí)結(jié)構(gòu)。只有當(dāng)DNA復(fù)制的時(shí)候，核小體才會(huì)打開，進(jìn)而轉(zhuǎn)錄因子這些的才能進(jìn)行調(diào)控。這部分打開的染色質(zhì)，就叫開放染色質(zhì)，打開的染色質(zhì)允許其他調(diào)控因子結(jié)合的特性稱為染色質(zhì)的可及性（chromatin accessibility）。

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因此對(duì)于預(yù)測一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的話，需要在其開放染色質(zhì)的基礎(chǔ)上預(yù)測到的結(jié)果才算是準(zhǔn)確的。所以今天就介紹一個(gè)預(yù)測人類染色體開放狀態(tài)的數(shù)據(jù)庫:?ATACdb[地址見文末].

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的人类染色质开放状态数据库，ATACdb使用介绍的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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