新一代测序技术的发展瓶颈有哪些?
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新一代测序技术的发展瓶颈有哪些?
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一項新一代測序技術NGS使用情況的用戶調查活動的調查結果顯示,目前新一代測序技術流程中最大的瓶頸是分析和注釋數據所花費的時間太長,大約有 32%的受訪者都將這些工作外包給生物信息學同事,或者第三方公司。目前大部分新一代測序技術研究工作主要集中在基礎研究和疾病相關的研究方面。這一調查受訪者中約有40%的研究人員參與了新一代測序研究,不過下半年的人數可能還會增加4%,還有一半受訪者表示在未來的兩年內,將計劃進行著方面的研究。調查顯示,數據的準確性和操作成本,這兩者是購買測序設備的最重要采購標準。但是如果兩種儀器的數據精確度相同,那么操作成本、應用的廣泛性,讀長和通量就成為了第二重要的參考因素。NGS 工作流程的最大瓶頸是分析和注釋數據所花費的時間太長。有四分之一的研究人員表示NGS數據分析需要至少一周時間,還有32%的受訪者將這一工作外包給其他生物信息學組同事或第三方公司。數據的準確性和操作成本,這兩者是購買測序設備的最重要采購標準。但是如果兩種儀器的數據精確度相同,那么操作成本、應用的廣泛性,讀長和通量就成為了第二重要的參考因素。每年NGS 數據注釋軟件的預算是外包費用的兩倍多,目前NGS 軟件整體平均預算約為8,500 美元,不過這一數據還表明,內部和外包所花費的費用存在巨大差異,前者的費用約為13,000-14,000美元,后者的費用為4500-6300 美元)。
設備性能不夠穩定!這個在中國也就幾臺新一代測序儀,但據說使用起來并不是很方便,操作不夠簡便,最主要的是性能不夠穩定,測序起來問題比較多,一般很少使用。這樣的設備肯定會阻礙技術的發展,希望能早日解決。
如果是有大批樣本一起上機的話,那么每個樣本平攤下來價格就會比較便宜了。
設備性能不夠穩定!這個在中國也就幾臺新一代測序儀,但據說使用起來并不是很方便,操作不夠簡便,最主要的是性能不夠穩定,測序起來問題比較多,一般很少使用。這樣的設備肯定會阻礙技術的發展,希望能早日解決。
如果是有大批樣本一起上機的話,那么每個樣本平攤下來價格就會比較便宜了。
總結
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